Głównym zadaniem Wydziału Projektów Aktywizacyjnych PUP jest prowadzenie działań związanych z aktywizacją w ramach Europejskiego Funduszu Społecznego Plus osób bezrobotnych zarejestrowanych w Powiatowych Urzędach Pracy Województwa Mazowieckiego. Realizuje je poprzez wdrażanie Działania FEMA.06.01 – Aktywizacja zawodowa osób bezrobotnych FEM 2021-2027.
 
W tym celu Wydział w szczególności  przygotowuje i przeprowadza nabory wniosków o dofinansowanie projektów w ramach Działania FEMA.06.01 – Aktywizacja zawodowa osób bezrobotnych.
Dlatego też dla ogłoszonych naborów organizuje pracę KOP oraz przygotowuje listy ocenionych projektów. 
 
Do kompetencji Wydziału należy także zawiadamianie projektodawców o wynikach oceny złożonych wniosków o dofinansowanie projektów i przygotowanie umów o dofinansowanie projektów wyłonionych w ramach ogłoszonego naboru wniosków.
 
Wydział ściśle współpracuje z beneficjentami w zakresie realizacji projektów, weryfikuje propozycje zmian w projektach oraz przygotowuje aneksy do umów.
Na etapie realizacji projektów Wydział Projektów Aktywizacyjnych weryfikuje wnioski o płatność składane przez Powiatowe i Miejskie Urzędy Pracy z terenu Mazowsza pod względem merytorycznym i formalno-rachunkowym. Ważnym elementem tej współpracy jest także monitorowanie projektów przyjętych do realizacji w zakresie finansowym i rzeczowym, wzywanie do zwrotu kwot nieprawidłowo wydatkowanych oraz przekazywanie informacji o nieprawidłowościach do Wydziału ds. Postępowań Administracyjnych EFS.
Dodatkowo Wydział w ramach wdrażanych działań z  Perspektywy Finansowej 2014-2022 prowadzi czynności związane z zamykaniem Działania 1.1 Poddziałania 1.1.1 POWER oraz Działania 8.1 RPO WM 2014 -2020.